Классификация магнитных гранул для экстракции нуклеиновых кислот
Со вспышкой нового коронавируса, хотя он и взят под контроль, все по-прежнему не могут относиться к нему легкомысленно. Каждый должен знать, что все подозреваемые случаи и пациенты с лихорадкой должны пройти тестирование на нуклеиновую кислоту, чтобы подтвердить, являются ли они новыми коронавирусами. Этапы обнаружения нуклеиновых кислот в основном делятся на три этапа:
1. Отбор образцов. Соберите образцы, которые могут содержать вирусы из дыхательных путей или других частей тела человека.
2. Экстракция: извлеките вирусную нуклеиновую кислоту из образца и отделите ее от других веществ.
3. Обнаружение: обнаружение извлеченного вируса методом количественной флуоресцентной ПЦР.
Среди них магнитные шарики являются одним из необходимых инструментов для экстракции нуклеиновых кислот. Итак, каковы классификация и функции магнитных шариков для экстракции нуклеиновых кислот?
Классификация и функция магнитных шариков: по свойствам поверхности их можно разделить на следующие три категории.
1. Силиконовые гидрокси-магнитные шарики.
Это один из наиболее широко используемых магнитных шариков. При использовании силанольных магнитных шариков для экстракции нуклеиновых кислот обычно требуются высокие концентрации хаотропных солей (NaI, NaClO4, GuHCI, GuSCN и т. Д.). Высокая концентрация солевых ионов может эффективно экранировать электростатическое отталкивание в растворе. В то же время ионы хаотропных солей могут также конкурировать с поверхностью магнитных шариков и молекул нуклеиновой кислоты, разрушать исходный гидратный слой на обеих поверхностях и способствовать адсорбции (водородная связь + сила Ван-дер-Ваальса) между поверхностью магнитных частиц. шарики и молекулы нуклеиновой кислоты. Поскольку обычно используемые хаотропные соли, такие как ионы гуанидина, оказывают ингибирующее действие на ПЦР, их необходимо удалять на последующих этапах промывки. Эффект удаления можно контролировать по коэффициенту поглощения.
2. Карбокси магнитные шарики
Помимо способности связывать молекулы нуклеиновой кислоты в среде с высокой концентрацией хаотропной соли, такие магнитные шарики могут связывать молекулы нуклеиновой кислоты с помощью другого особого механизма. При добавлении в раствор определенной концентрации PEG и NaCl молекулы нуклеиновой кислоты могут постепенно свернуться из вытянутой конформации в форму небольшого шара, и большая часть отрицательных зарядов на ней также экранируется, что способствует адсорбции нуклеиновой кислоты. молекулы кислоты к магнитным шарикам. Чем больше молекулярная масса молекулы нуклеиновой кислоты, тем более вероятно, что произойдет это конформационное изменение от вытянутой спирали до свернутого шарика. Следовательно, регулируя объемное отношение раствора соли к образцу нуклеиновой кислоты, можно получить фрагмент нуклеиновой кислоты с большей молекулярной массой на карбоксильных магнитных шариках. Благодаря преимущественной адсорбции на поверхности достигается так называемый эффект экранирования фрагментов.
3. Амино / имидазолиловые и другие положительно заряженные магнитные шарики.
Такие магнитные шарики могут легко реализовать обратимое связывание молекул нуклеиновой кислоты на поверхности путем регулирования pH. Однако из-за того, что положительно заряженная поверхность слишком сильно адсорбирует молекулы нуклеиновой кислоты, выход легко может быть низким. Следовательно, использование положительно заряженных магнитных шариков не так широко распространено, как силанольные и карбоксильные магнитные шарики.
Классификация и функция магнитных шариков для экстракции нуклеиновых кислот подробно объяснены выше. Aisen использует нанобиомагнитные шарики в качестве ядра для производства экстракторов нуклеиновых кислот и соответствующих им наборов для экстракции нуклеиновых кислот на магнитных шариках.
