Как выбрать подходящую систему экстракции нуклеиновых кислот, и в чем заключаются недоразумения при выборе?

В связи с быстрым развитием биотехнологии с применением технологии ПЦР в различных областях, включая обнаружение медицинских заболеваний, обнаружение сельскохозяйственных генетических модификаций и многие другие приложения, высокопроизводительная экстракция нуклеиновых кислот из образцов стала чрезвычайно актуальной, и многие компании начали с Инструмент автоматического извлечения нуклеиновой кислоты, есть различные принципы. Чтобы выбрать подходящий инструмент для автоматической экстракции нуклеиновых кислот, требуется подробный анализ.

С точки зрения принципа экстракции существуют метод спиновой колонки и метод магнитных шариков. Система автоматической экстракции нуклеиновых кислот методом центробежной колонки использует центрифугу и автоматическое пипеточное устройство для объединения метода. Пропускная способность обычно составляет 1-12 проб. Время аналогично ручному извлечению. Это не повышает эффективность, да и цена не из дешевых. Не универсальный, подходит для лабораторий с достаточным финансированием.

Автоматическая система экстракции нуклеиновой кислоты методом магнитных шариков делится на метод магнитного стержня и метод всасывания. Во-первых, метод всасывания. Как следует из названия, метод отсасывания осуществляется с помощью автоматического дозатора, а раствор для лизиса и магнитные шарики добавляются через автоматическое дозирующее устройство. Адсорбция, аспирация лизата, добавление промывочного раствора, адсорбция с помощью магнитных шариков, аспирация промывочного раствора и добавление буфера для элюирования.

Кажется, что нет никаких проблем с этапами, но самая большая проблема с методом всасывания заключается в том, что для того, чтобы не удалить магнитные шарики при удалении отработанной жидкости, пипетка не должна находиться слишком близко к магнитным шарикам, чтобы предотвратить магнитные шарики. и отработанная жидкость от всасывания. Всегда есть небольшая часть сточной жидкости, которую невозможно полностью удалить каждый раз, особенно устройство с магнитом внизу. Поскольку магнитные шарики адсорбируются магнитом снизу, пипетка не может быть слишком близко ко дну, так что промывочный раствор не может быть полностью удален. Удаление остаточной соли и этанола в промывочном растворе повлияет на последующую эффективность элюирования и успешность ПЦР; магнит на боковой стороне устройства будет иметь меньше остаточной жидкости, но эффективность элюирования невысока, поскольку ДНК растворяется в стирке. В очищенном от буфера растворе, если вы не ждете более получаса, поэтому на некоторых 96 рабочих станциях автоматической экстракции нуклеиновых кислот время цикла экстракции занимает 150 минут, а метод с 32 магнитами может занять 5 циклов за одно и то же время. .

Поговорим о системе экстракции нуклеиновых кислот методом магнитных стержней. У потока обычно 8, 16, 32, 96 каналов. По сравнению с методом всасывания преимущество метода магнитного стержня заключается в том, что жидкость на каждом этапе не остается, потому что магнитный стержень только забирает магнитные шарики и передает Go в соответствующую реакционную лунку на следующем этапе. Кроме того, экстракционный инструмент метода магнитного стержня должен быть более полным, например нагревательный, и каждый нагревательный резервуар должен иметь независимый контроль температуры, чтобы можно было настроить нагрев, лизис и элюирование. Различные температуры, еще один очень важный момент заключается в том, что двигатель, который приводит в движение магнитный стержень, должен иметь возможность приводить магнитный стержень в движение, чтобы быстро перемешивать и перемешивать жидкость, чтобы облегчить автоматизацию и помочь лизису и тщательному промыванию.

При выборе магнитного стержня лучше всего выбрать 32 канала. Кажется, что 96 каналов имеют более высокий поток, но есть очень практическая проблема. Когда 96 магнитных стержней переносятся с одной пластины на другую, магнитные стержни находятся наверху. Что делать, если жидкость упадет на полпути, капнет в другие отверстия и вызовет загрязнение, а 32-канальный магнитный стержень не пройдет по небу над другими образцами, поэтому перекрестного загрязнения не будет.

Вышеупомянутое является подходящим введением о выборе системы экстракции нуклеиновых кислот, но многие люди все еще легко ошибаются в понимании выбора. Следующие примеры иллюстрируют два наиболее распространенных недоразумения:

Заблуждение 1: разница между системой экстракции нуклеиновых кислот и рабочей станцией и неправильное понимание выбора

Многие производители рабочих станций часто говорят своим клиентам, продвигая свои рабочие станции, что система экстракции нуклеиновой кислоты полностью автоматическая, а система экстракции нуклеиновой кислоты — полуавтоматическая. Клиенты также субъективно думают, что рабочая станция может пипетировать, извлекать и делать что угодно, как если бы просто поместили образец. Войдите, вы можете получить нужную нуклеиновую кислоту, не беспокоясь ни о чем. Когда рабочая станция находится на месте, оказывается, что на самом деле все не так. Это не только не так хорошо, как ожидалось, но даже экстракция основной нуклеиновой кислоты затруднена. Так в чем причина? ?

Первый вопрос — проблема открытия крышки. Конструкции крышек пробирок для забора крови, пробирок для хранения слюны и пробирок для криоконсервации с двумерным кодом различаются, размеры и производители различаются. Как автоматически открывать крышку на рабочем месте? Эта проблема больше не решена.

Вторая проблема — это ввод штрих-кодов, штрих-кодов и QR-кодов, а также некоторых наклеенных вручную этикеток и рукописных этикеток, поэтому сканирование кодов по-прежнему выполняется вручную, что трудно автоматизировать.

Третья проблема заключается в том, что добавление жидкости автоматизировано. Рабочая станция может автоматически добавлять реагенты, что кажется преимуществом, но для добавления 96-луночного планшета требуется около 15-30 минут, а для экстракции обычно требуется шесть реагентов, то есть шесть планшетов. На это уходит около 1,5 часов. Многие экстракционные реагенты содержат этанол в высокой концентрации. В течение такого длительного времени концентрация этанола будет изменяться, что повлияет на эффективность и чувствительность экстракции. Кроме того, многие производители инструментов для экстракции имеют предустановленные комплекты, которые не нужно добавлять. жидкость.

Недоразумение 2: разница между импортным и отечественным производством, это самое большое недоразумение выбора.

Многие выбирают системы экстракции нуклеиновых кислот, исходя из привычного мышления, и считают, что импортные лучше отечественных; однако экстракторы нуклеиновых кислот представляют собой оборудование, ориентированное на применение, а не основное экспериментальное оборудование, не то оборудование, которое можно использовать после подключения к сети. Для экстракции нуклеиновых кислот требуется общее взаимодействие инструментов, вспомогательных наборов и прикладных программ. Производители должны выбрать наиболее подходящие наборы и процедуры для экстракции в соответствии с типом образца. Реагенты и процедуры часто нуждаются в оптимизации. Без технической поддержки производителя вы не сможете его использовать. . Это хорошо объясняет, почему многие импортные рабочие станции и экстракционные инструменты никем коллективно не используются; техническая поддержка импортных инструментов не успевает за ними, а технические посещения импортных инструментов требуют дорогих пошлин, и нет гарантии, что их можно будет использовать. Помогите клиентам оптимизировать экспериментальный план (конечно, необходимо взимать плату за доставку от двери до двери).

В целом, большинство систем экстракции нуклеиновых кислот не могут идти в ногу с отечественными производителями по удобству работы с прибором, чувствительности и производительности экстракции, комплектов инструментов, возможностям модернизации и настройки прибора и т.д. больше расстраивает. Нет необходимости доказывать превосходство импорта. Из приведенного выше обсуждения мы должны понять, что при выборе системы экстракции нуклеиновой кислоты лучше всего провести полное исследование или испытание, чтобы не попасть в пассивную ситуацию покупки системы экстракции нуклеиновой кислоты.