核酸的分离纯化方法
核酸是遗传信息的重要载体和重要的生物信息分子。它在人们的生物学研究过程中起着关键作用。目前,有许多分离和纯化核酸的方法。最常用的是(异)胍硫氰酸盐。什么是苯酚-氯仿的一步法,下面简要介绍该方法。
由于RNase的影响,为了获得完整的RNA分子,有必要在核酸分离和纯化的初始阶段尽快使细胞内RNase的活性失活。在β-巯基乙醇的协同作用下,高浓度(异)胍硫氰酸盐可以极快地抑制RNase的活性,并可以从胰腺和其他富含RNase的组织细胞中分离出完整的RNA分子,现已成为一种常规方法。用过的试剂。对于含量较低的样品,添加糖原可以提高RNA的回收率。一步法最常用于总RNA提取。
1,(异)胍硫氰酸胍和氯仿一步法
(异)胍硫氰酸酯-苯酚氯仿法是一种经典的一步法,由Chomczynski和Sacchi在1987年提出。它用含有4mmol / L异硫氰酸胍和0.1mmol / Lβ-巯基乙醇,然后在pH 4.0的酸性条件下用苯酚/氯仿萃取裂解液,最后通过用异丙醇沉淀并用75%乙醇洗涤来制备RNA。与以前的(异)胍硫氰酸异氰酸酯-CsCl超速离心法相比,该方法简单,经济,高效,可同时处理多个。标本以及RNA的完整性和纯度都很高。它仍然用于从培养的细胞和大多数动物组织中分离和纯化核酸。
总RNA的产量取决于样品的初始量。每毫克组织的总RNA产量约为4-7 g,每106个细胞约为5-10 g。但是,该方法不适用于从富含甘油三酸酯的脂肪组织中提取RNA,有时RNA会被多糖和蛋白聚糖污染。这些污染物将影响乙醇沉淀后RNA的溶解,同时抑制RT-PCR反应。它通过与膜结合而影响RNA杂交中的印迹步骤。脂肪组织RNA的提取可以用(异)胍硫氰酸氰酸盐-CsC1超速离心方法代替。当多糖和蛋白聚糖的污染严重时,可以通过添加有机溶剂提取步骤并更改RNA沉淀条件来消除下一种方法。
2,可同时制备RNA,DNA和蛋白质的一步法
该方法是(异)胍硫氰酸氰酸酯-苯酚氯仿一步法的改进方法。它使用(异)胍硫氰酸氰酸酯-酚单相裂解试剂裂解细胞,然后添加氯仿以形成两相。变性的DNA和蛋白质位于两相的界面,保留在上层水相中的RNA是通过异丙醇沉淀和在RNA沉淀溶液中75%Z醇洗涤而制备的。 RNA沉淀溶液的组成为1.2mmol / L的NaCl和0.8mmol / L的柠檬酸二钠。
由于使用了RNA沉淀溶液,用这种方法制备的RNA样品很少被多糖和蛋白聚糖污染,可用于mRNA纯化,Northern杂交,逆转录和RT-PCR反应。界面处的DNA和蛋白质可以分别被乙醇和异丙醇沉淀。通过这种方法制备的DNA大小约为20 kb,可以用作PCR反应的模板,而蛋白质样品主要用于蛋白质印迹。目前,该方法有多种可商购的单相裂解试剂可供选择。它是最常用的总RNA提取方法,其收率等同于异氰酸异硫氰酸胍-苯酚氯仿一步法。
3,其他方法
核酸的分离和纯化有很多,例如LiC1-脲法,(异)胍硫氰酸氰酸酯-CsCl超速离心法,热酚法,盐酸胍-有机溶剂法等,由于各种原因现在很少使用。
目前,Ascend已形成涵盖多种生物样品的专业核酸自动纯化程序。