如何选择合适的核酸提取系统,选择误区有哪些?

生物技术的发展日新月异,随着PCR技术在各个领域的应用,包括医学方面疾病检测、农业方面转基因检测以及其他很多方面的应用等,高通量的样本核酸提取已经变得极为迫切,很多公司推出了全自动核酸提取的仪器,各种原理的都有,如何选择一款合适的核酸自动提取仪,就得细细分析。

从提取原理上来看,有离心柱法、磁珠法。离心柱法全自动核酸提取系统采用离心机和自动移液装置想结合的方法,通量一般在1-12个样本 ,时间上和手工提取差不多,并不能提高效率,价格也不便宜,耗材还不通用,适合经费充足的实验室使用。

磁珠法自动核酸提取系统又分为磁棒法和抽吸法,先说抽吸法,顾名思义,抽吸法就是通过自动移液装置来进行,通过自动移液装置来加入裂解液、磁珠吸附,抽走裂解液,加入漂洗液,磁珠吸附,抽走漂洗液,加入洗脱缓冲液。

HERO 96

从步骤上好像没什么问题,但是抽吸法最大的问题在于,为了在去除废液的时候不抽走磁珠,移液器不能靠磁珠太近,以防磁珠连同废液被抽掉,这样每一次抽废液的时候总有一小部分不能彻底的抽走,特别是磁铁在底部的装置,因为磁珠被磁铁吸附在底部 ,所以移液器不能靠底部太近,这样漂洗液就不能完全去除,残留的漂洗液中的盐和乙醇会影响后面的洗脱效率和PCR成功率;磁铁在侧面的装置残留的液体会少些,但是洗脱的效率也不好,依靠DNA自行溶解到洗脱缓冲液中,除非等上半小时以上,所以有些96自动核酸提取工作站,提取-轮的时间需要150分钟, 32磁棒法的同样的时间可以提5轮了。

再说磁棒法核酸提取系统,通量通常有8、16、 32、 96通道,相对于抽吸法,磁棒法的优点是每一步的液体不残留,因为磁棒只带走磁珠,转移到下一个步骤相应的反应孔中,另外选择磁棒法的提取仪器最好要功能更齐全的,比如可以加热,每个加热槽最好独立温控,这样可以设置加热、裂解、洗脱的不同温度,另外很重要的一点是,带动磁棒的电机要能带动磁棒进行液体的快速混匀和搅拌,这样才有利于自动化和有助于裂解和漂洗彻底。磁棒法的通量选择最好是32通道, 96通道的看似通量更高,但是有个很现实的问题, 96个磁力棒在从一个板转移至另外一个板的时候,磁力棒上面的液体中途滴下来怎么办,它会滴到别的孔中造成污染,而32通道的磁力棒运行轨迹不经过其他样本的上空,这样不会交叉污染。

以上就是关于核酸提取系统选择的相关介绍,但很多人还是很容易陷入选择误区,下面举例说明最常见的二种选择误区:

HERO 32

误区一、核酸提取系统和工作站的区别及选择误区

很多工作站的厂家在推销工作站的时候经常和客户说,工作站提核酸是全自动的,而核酸提取系统是半自动的,客户也主观认为工作站可以移液,提取,什么都能干,好像只要把样本放进去,什么都不用管就可以得到想要的核酸了,等到工作站到位的时候发现,实际情况并不是那样,不仅没想象中的那么好,甚至连基本的提取核酸都困难,那么原因是什么呢?

第一个问题,开盖问题,采血管、唾液保存管、二维码冻存管等的盖子结构都不一样,大小也不一样,厂家也不一样,工作站如何自动化开盖?这个问题就解决不了。

第二个问题,条码录入问题,条形码和二维码,还有-些手动贴的标签和手写的标签,所以扫码还是手动为主,很难自动化。

第三个问题,加液自动化,工作站可以实现自动加试剂,好像是个优势,但是加一个96深孔板需要花15~30分钟左右的时间,而提取一般需要六种试剂,也就是六个板子,大约1.5小时时间,提取试剂很多含有高浓度的乙醇,这么长时间,乙醇浓度会发生改变,影响提取效率和灵敏度,再说了,很多提取仪的厂家(比如百泰克,百源基因等)都有配套预装试剂盒,不需要加液,自动加试剂这个功能就是个鸡肋。

误区二、进口和国产的区别,这个是最大的选择误区

很多人在选择核酸提取系统的时候是依据习惯性思维,认为进口的比国产的好;但是核酸提取仪是属于应用型设备,不是基础实验设备,不是那种插上电就可以用的设备,核酸提取需要仪器、配套试剂盒和应用程序的整体配合,需要厂家根据样本类型选择最适合的提取试剂盒和程序,经常需要优化试剂和程序,没有厂家的技术支持,你是无法用的好的。这就很好的解释了为什么很多进口工作站、提取仪集体趴窝,没有人用的原因;进口仪器应用技术支持跟不上,进口仪器技术上门都需要很贵的上门费,而且并不能保证能帮客户把实验方案优化出来(当然上门费都要收)。

综合上,多数核酸提取系统在仪器操作系统便捷性、仪器提取灵敏度和得率、仪器配套试剂盒、仪器的升级改造定制能力等方面都赶不上国内厂家,而且售后服务收费贵更是硬伤,实在没有必要再去论证进口的优越性了。通过以上的论述,我们应该清楚,在选择一款核酸提取系统的时候,最好充分的调研或者试用,以免陷入买了不能用的被动局面。